Los trastornos plaquetarios hereditarios (TPC), son un grupo heterogéneo de unas 75 enfermedades raras, que, en muchos casos, se manifiestan clínicamente con diátesis hemorrágica, alteraciones sindrómicas relevantes en diferentes órganos y tejidos, o riesgo alto de desarrollar neoplasias hematológicas. Su diagnóstico precoz y preciso, también a nivel genético, es fundamental para el adecuado seguimiento y manejo clínico de los enfermos.
En la actualidad, el diagnóstico genético de los TPC se aborda principalmente mediante el análisis del ADN por la secuenciación de secuencias cortas con alto rendimiento (HTS o NGS). Sin embargo, estos métodos de secuenciación no son eficaces para detectar grandes alteraciones moleculares estructurales, como extensas deleciones, inversiones o duplicaciones (variantes estructurales [VE]).
En un estudio realizado por el Grupo Español de Alteraciones Plaquetarias Congénitas (GEAPC) de la Sociedad Española de Trombosis y Hemostasia (SETH), Ana Zamora y col. han usado la secuenciación de lecturas larga del ADN (sin manipulación alguna) con la tecnología nanoporo, para detectar VE en pacientes con TPC. En concreto, el uso de nanoporo les ha permitido resolver el diagnóstico molecular en cuatro pacientes con diagnóstico clínico y de laboratorio de Trombastenia de Glanzmann (TG) y de síndrome de Hermansky-Pudlak (HPS).
En los dos casos con TG, no relacionados entre sí, identifican una VE compleja consistente en una deleción + inversión + duplicación, que afecta a los exones 2-6 del gen ITGB3. La variante está en homocigosis en uno de los pacientes, mientras que en el segundo caso está heterocigosis compuesta con una variante de splicing (c.2301+1G>C) en el otro alelo de ITGB3. También encuentran que los casos con HPS están causados en un caso por una deleción homocigota de los exones 19-22 de gen HPS5, y en el otro por la combinación de una mutación de parada (c.2464C>T [p.Arg822*] y una deleción de los exones 2-4 en el gen HPS3. La caracterizaron detallada de estas VE alcanzada con nanoporo, permitió la identificación de elementos repetitivos Alu en los puntos de rotura y el diseño de PCRs específicas con las que se pudo realizar el cribado familiar de las mutaciones.
Este trabajo del grupo GEAPC demuestra que la tecnología de nanoporos supera las limitaciones de las técnicas estándar de secuenciación de lectura cortas del ADN y permite la caracterización de VE complejas y el diagnóstico molecular de pacientes con TPC genéticamente muy raros.
El estudio acaba de ser publicado “online” en la revista Journal of Thrombosis and Hemostasis (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38007062/) (Zamora-Cánovas A, Morena-Barrio B, Marín-Quilez A, Sierra-Aisa C, Male C, Fernández-Mosteirin N, Trapero-Marugán M, Padilla J, Garrido-Rodriguez P, Sánchez-Fuentes A, Rodríguez-Alen A, Gómez-González PL, Revilla N, de la Morena-Barrio ME, Bastida JM, Corral J, Rivera J, Lozano ML. Targeted long-read sequencing identifies and characterizes structural variants in cases of inherited platelet disorders. J Thromb Haemost. 2023 Nov 23:S1538-7836(23)00844-9. doi: 10.1016/j.jtha.2023.11.007. Epub ahead of print. PMID: 38007062.)
Grupo de investigación Plaquetas y Grupo de investigación Antitrombina, del Centro Regional de Hemodonación de Murcia, donde se ha realizado el estudio de diagnóstico molecular de trastornos plaquetarios congénitos mediante secuenciación con Nanoporo.
— José Rivera Pozo
Servicio de Hematología y Oncología Médica, Hospital Universitario Morales Meseguer, Centro Regional de Hemodonación, Universidad de Murcia, IMIB-Arrixaca, CIBERER-U765. Murcia
